Research Article

Ezh2 rip-seq识别组织特异性长非编码rna。

卷 18, 期 5, 2018

页: [275 - 285] 页: 11

弟呕挨: 10.2174/1566523218666181008125010

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摘要

背景:多梳抑制复合物2(PRC 2)催化H3 Lys 27的组蛋白甲基化,在许多系统的发育和疾病过程中起着至关重要的作用。它的催化亚基EZH 2是长非编码RNA(IncRNAs)的关键核靶点,它是一种新兴的表观遗传调节剂,参与多种细胞过程。INcRNA具有较高的组织特异性,但对EZH 2相互作用的IncRNAs的组织特征了解甚少。目的:采用RNA免疫沉淀和RNA测序相结合的方法,对脑、肺、心、肝、肾、肠、脾、睾丸、肌肉和血液等组织中EZH 2结合的INcRNAs进行全局筛选。我们鉴定了1328个EZH_2结合的INcRNAs,其中470个在至少两个组织中共享,858个在单个组织中被检测到。在许多incRNAs中发现了一个具有特殊二级结构的RNA基序,尽管不是所有EZH 2结合的incRNAs。EZH 2结合的INcRNA可分为4类:基因间INcRNA、反义INcRNA、内含子相关INcRNA和启动子相关INcRNA。启动子相关的INcRNA Hnf1aos1与肝脏中的EZH 2特异结合,与其配对编码基因HNF1A具有相同的特征,进一步证实了本研究的有效性。除了已知的EZH 2结合的INcRNAs,如Kcnq1ot1、Gas5、Meg3、Hotair和MALAT 1之外,大多数的INcRNAs被报道与EZH 2有关。结论:我们的发现提供了EZH 2-相互作用于不同组织的INcRNAs的剖面图,并提示了INcRNAs在细胞分化和成熟过程中的关键作用。表观遗传学,长非编码RNA,组织特异性,PRC 2,EZH 2,组蛋白甲基化

关键词: 表观遗传学,长非编码RNA,组织特异性,PRC 2,EZH 2,组蛋白甲基化


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